تأسست كلية العلوم مع تأسيس الجامعة عام 1995، إذ كانت تضم بالإضـافة إلى الأقسـام العلمـية أقسام: كـلية الآداب، وقسمـي الجيولوجيا والحـاسوب اللذان بقيا تـــحت مظلة كلية العلوم والآداب إلى أن تبلورت فكرة إنشاء كليــة الموارد الطبيـعية والبيئة؛ لينضوي تحت لـوائهـا قسـم الجيولــوجيا، وإنشــاء كليـة الأمير الـحسين بن عبد الله الثــاني لتكــنولوجيا المعلومـات؛ لينضوي تحـت لــوائهـــا قسم الحاسوب.
وبقيت الكلية تحمل اسم كلية العــلوم والآداب حتى مطلــع عام 2005، إلى أن صدر قرار فصل كلية العلوم عن كلية الآداب مع بداية العـــام الجامعي 2005/2006.
تــضم كليـــة العلوم خمسة أقسام هي: الرياضيات، والفيزياء، والكيمياء، والعلوم الحياتية والتكنولوجيا الحيوية، وقسم العلوم الأساسية المساندة.
و تمنح الكلية درجة البكالوريوس في التخصصات التالية: الرياضيات، والفيزياء، والكيمياء، والعلوم الحياتية، والتكنولوجيا الحيوية، كما تمنح درجة الماجستير (مسار الرسالة) في التخصصات التالية: والفيزياء التطبيقية، والكيمياء والعلوم الحياتية، والرياضيات.