دائرة البرمجة وتطبيقاتها
دائرة البرمجة وتطبيقاتها، هي الدائرة المسؤولة عن حوسبة أعمال الجامعة، وتشمل أعمال الحوسبة: (تحليل وتصميم وتطوير وتنفيذ) حلول محوسبة (نظم المعلومات وتطبيقاتها) في مختلف الكليات والمراكز، والوحدات والإدارات التابعة للجامعة، بالإضافة إلى الخدمات الإلكترونية بما فيها موقع الجامعة والبوابات الإلكترونية.
قامت الدائرة، وبجهود ذاتية بالبدء في تطوير الأنظمة المحوسبة ابتدءً من نظام القبول والتسجيل، والنظام المالي، والرواتب، والموارد البشرية، ونظام اللوازم والمستودعات، ولتشمل بعد ذلك جميع نواحي الجامعة، فتمّ تطويرهذه الأنظمة باستخدام تقنيات قاعدة البيانات أوراكل، كما قامت الدائرة ببناء العديد من الخدمات الإلكترونية، والبوابات، والموقع الإلكتروني، والعديد من الأنظمة المعتمدة على الإنترنت.
 دائرة البرمجة وتطبيقاتها هي الدائرة الوحيدة في الجامعة المسؤولة عن حوسبة كافة أعمال الجامعة، والتي هي في تزايد مستمر نظرًا للتطور في تكنولوجيا المعلومات، وللطلب المستمر في حوسبة الدوائر، ونظرًا للتغير المستمر في التعليمات والأنظمة، والتي يتبعها تعديل الأنظمة المحوسبة وتطويرها، أدى هذا إلى تزايد الأعمال المطلوبة من دائرة البرمجة، وبالعكس إلى تبسيط الإجراءات الإدارية، وإلى تقليل حجم العمل الإداري في الدوائر التي تم حوسبت إعمالها.
وتتميزدائرة البرمجة بكادر مهنيي مميز، ووذي قدرة كبيرة على حلّ المشاكل البرمجية بفعالية، والعمل على توفير كافة الحلول للمشاكل العالقة، والحيلولة دون وجود عوائق أمام الطلبة والموظفين، من أجل ديمومة أنظمة الجامعة الإلكترونية، والوصول إلى حالة الجامعة الإلكترونية.
وتقوم دائرة البرمجة بتواصلها المستمر مع جميع الكليات، والوحدات الإدارية في الجامعة، وتعمل الدائرة على تحديد وتطبيق، وتنفيذ مشاريع تساهم في تنمية المجتمع المحلي، من خلال تطبيقات تكنولوجيا المعلومات، وتهدف الدائرة إلى تطوير أنظمة الجامعة إلكترونيًا ضمن مفهوم الجامعة الإلكترونية.

وتحتوي الدائرة على الشعب التالية:
شعبة التطبيقات الأكاديمية
شعبة التطبيقات الأكاديمية: تُعنى بتحليل جميع الأنظمة الأكاديمية وتطويرها ومعالجتها، ويعتبر قلب الأنظمة الأكاديمية "الطالب", منذ تقدمه بطلب الالتحاق بالجامعة، ومن ثم قبوله بالجامعة وتسجيله، وتقدمه للامتحانات الإلكترونية، والورقية لغاية حصوله على الدرجة العلمية،  وتخرجه، كما يتمّ التعامل مع أيّ تغيير يطرأ على سياسة الجامعة الخاصة بالطلبة، من اعتماد نظام علامات جديد، أو طريقة دفع جديدة، أو خطة دراسية جديدة بسرعة ودقة وجدية، وتقسّم الأنظمة الأكاديمية إلى أنظمة تعمل من داخل الجامعة، كأنظمة سطح المكتب، مثل نظام القبول والتسجيل، ونظام مالية الطلبة، وغيرهما،  وأنظمة تعمل من داخل الجامعة وخارجها عن طريق الإنترنت، مثل نظام الهيئة التدريسية، وغيرها.

شعبة التطبيقات الادارية
شعبة التطبيقات الإدارية: تُعنى بتحليل جميع الأنظمة الإدارية وتطويرها ومعالجتها، ويعتبر قلب الأنظمة الإدارية "الموظف". قامت الشعبة بتطوير نوعين من الأنظمة: أنظمة تعمل من داخل الجامعة وخارجها عن طريق الإنترنت، مثل نظام إدارة الجامعة، أمّا النوع الآخر فهي تطبيقات سطح المكتب، مثل: النظام المالي، ونظام الديوان، والأرشفة الإلكترونية، ونظام اللوازم، ونظام الموارد البشرية، ونظام الهاتف، ونظام العطاءات المركزية، وغيرها من الأنظمة المطبقة في مختلف دوائر الجامعة ووحداتها.

شعبة تطبيقات الإنترنت
شعبة تطبيقات الإنترنت: تُعنى بتطوير تطبيقات الإنترنت والنشر الإلكتروني ومتابعتها، ومعالجة جميع أنواع المشاكل التقنية، والفنية والبرمجية لكافة تطبيقات الإنترنت المعلوماتية، وتقوم الشعبة بإنشاء تطبيقات الإنترنت وتعديلها وتنفيذها، وربطها مع قواعد البيانات الفعالة، والتفاعل مع التطبيقات الأخرى، كما تعمل الشعبة على تطوير خدمات الإنترنت، وحماية تطبيقات الويب، من خلال تطبيق التقنيات، والاستراتيجيات المناسبة، وتقوم الشعبة بإنشاء مواقع وظيفية وديناميكية وصيانتها، من خلال تطبيق مهارات التصميم الجرافيكي، والويب ومبادئه المختلفة.
 
شعبة فحص التطبيقات
يقع على عاتق هذه الشعبة مسؤولية فحص الأنظمة، والبرامج والخدمات المحوسبة، وضمان جودة الأنظمة  المستخدمة في الجامعة، والمطورة من قبل شعبه الأنظمة الأكاديمية والإدارية، وشعبة تطبيقات الإنترنت.  
 ويتعلق ضمان جودة الأنظمة بعملية تطوير الأنظمة  بأكملها، والتي تشمل عمليات عديدة، كتحديد المتطلبات، وتصميم البرمجية والبرمجة، وتنظم عمليات ضمان الجودة تكون في أهداف وأنشطة، ومهام ومقاييس مختلفة؛ وتهدف العملية إلى تأكيد جودة الأنظمة، من خلال فحص مكونات الأنظمة؛ للتأكد من خلوها من الأخطاء، ومطابقتها للمواصفات والمعايير الموضوعة من قبل مستخدمي الأنظمة، وذلك قبل إصدارها إلى المستخدمين المعنيين بها.

شعبة إدارة قواعد البيانات
تقوم الشعبة بالإشراف على قاعدة بيانات الجامعة، من حيث الحفاظ على تناسق المعلومات المخزنة وسلامتها وسرّيتها، والتي تشمل كافة معلومات الجامعة: (معلومات طلاب، ومدرسين، وعلامات، ومعلومات مالية....الخ)، كما تقوم الشعبة بمتابعة النسخ الاحتياطي لقاعدة البيانات، والتأكد من سلامة الإجراء للرجوع إليها عند الحاجة، أو في حالات الطوارئ، وتعمل الشعبة على التأكد من عمل خوادم قاعدة البيانات بشكل سليم، وعلى مدار الساعة يومًا بيوم؛ ليستمرعمل الأنظمة والخدمات الإلكترونية دون أيّ أعطال، وذلك داخل الدوام أو خارج أوقات العمل الرسمية، أو أثناء العطل الرسمية.