- مختبر الصيدلة الصناعية (الأشكال الصيدلانية الصلبة).
- مختبر الصيدلة الصناعية (الأشكال الصيدلانية السائلة وشبه الصلبة).
- مختبر صيدلة صناعية (التحليل وضبط الجودة).
- مختبر بحث صيدلة صناعية.
- مختبر بحث صيدلانيات.
- مختبر أبحاث الجلد.
- مختبر الأحياء الدقيقة الصيدلانية.
- مختبر التراكيب الصيدلانية.
- مختبر الصيدلة الفيزيائية.
- مختبر بحث أحياء دقيقية صيدلانية.
- مختبر تحليل الذوبان الدوائي الأوتوماتيكي.
بالإضافة للمختبرات التي تتبع الأقسام، فإنّ الكلية تحتوي على مختبرات تخدم أعضاء هيئة التدريس والطلبة، وهي:
- مختبر البحث المركزي.
- مختبر زراعة الخلايا.
- مختبر أبحاث لطلبة البكالوريوس.
- مختبر أبحاث لطلبة الماجستير.
- مختبر أبحاث الجينوم.