تم انشاء قسم العلوم الطبية المخبرية في الجامعة الهاشمية سنة 1999 لبرنامج البكالوريوس بواقع (136) ساعة معتمدة موزعة على أربع سنوات دراسية. ويهدف القسم منذ تأسيسه إلى الارتقاء بجودة المخرجات الأكاديمية من خلال تدريس الطلبة وتدريبهم على احدث ما توصل اليه العلم في مجال العلوم الطبية المخبرية واكسابهم المهارات اللازمة لممارسة مهنية متميزة في اجراء الفحوصات المخبرية وبأعلى جودة ودقة وتعزيز أخلاقيات المهنة، وتشجيع البحث العلمي التطبيقي. وللمساهمة بتحقيق رؤية ورسالة الجامعة الهاشمية في تقديم خدمات التعليم والبحث العلمي المتقدم، تم فتح برنامج الماجستير في العلوم الطبية المخبرية سنة 2009، حيث تم توفير بيئة تعليمية وبحثية تعزز التفكير الإبداعي في فروع علوم المختبرات الطبية المختلفة باحترافية عالية واكسابهم المهارات اللازمة في عمل الابحاث العلمية ونشرها في المجلات المعترف بها عالميا ومحليا واعطائهم الدافعية لتكملة مرحلة الدكتوراة في جامعات عالمية مرموقة، وايضا رفد سوق العمل بالكفاءات المؤهلة في مجال العلوم الطبية المخبرية الحديثة التي تقدم الرعاية الصحية والتشخيصية على اعلى مستوى بما يخدم المجتمع المحلي ومختلف الدول العربية والعالمية. تم تخريج اكثر من 2750 طالباً وطالبة من برنامج البكالوريوس و150 طالباً وطالبة من برنامج الماجستير حتى نهاية العام الجامعي 2025\2024، ويدرس في القسم عدداً من اعضاء هيئة التدريس المميزين والحاصلين على شهاداتهم من جامعات عالمية متميزة ومرموقة وفي مجالات علمية مختلفة، تشمل الكيمياء الحيوية والسريرية، علم الدم التشخيصي وبنك الدم، علم البيولوجيا الجزيئية التشخيصية، علم المناعة والامصال، علم الاحياء الدقيقة التشخيصية، وعلم التشريح والانسجة وعلم وظائف الأعضاء. ومن اجل تحقيق هذه الاهداف:

يقدم القسم منح دراسية لايفاد الطلبة لانهاء مرحلة الدكتوراة في جامعات عالمية مرموقة في مختلف دول العالم.
يقوم القسم بعقد مؤتمرات وعمل ندوات علمية في مختلف حقول العلوم الطبية المخبرية.
يعمل القسم على دعم البحث العلمي بالتعاون مع عمادة البحث العلمي لتجهيز مختبرات الهيئة التدريسية البحثية بافضل واحدث الاجهزة العلمية والتي تستقبل طلبة الماجستير لاجراء بحوث رسائل الماجستير وبحوث اعضاء الهيئة التدريسية.
يعمل القسم على تشجيع التعاون البحثي بين اعضاء الهيئة التدريسية في القسم مع اقسام اخرى من الجامعة وايضا من جامعات محلية وعالمية.
يشجع القسم اعضاء الهيئة التدريسية للاشراف على طلبة الماجستير وايضا على عمل دورات عن طريق مركز الدراسات والاستشارات.
يستقطب القسم الكفاءات المختلفة عن طريق التبادل بين اعضاء الهيئة التدريسية لمختلف الجامعات المحلية والعالمية (التفرغ العلمي) وايضا استقبال الاساتذة الزائرين في القسم.