تم افتتاح قسم الهندسة الطبية الحيويةللعام الأكاديمي 1999/2000 كأحد أقسام كلية الهندسة في الجامعة الهاشمية.

يقدم قسم الهندسة الطبية الحيوية برنامج البكالوريوس في الهندسة الطبية مدته خمس سنوات  بواقع 160 ساعة معتمدة، ويهدف إلى تحضير خريجي القسم لجميع مجالات الهندسة الطبية الحيوية في الأردن والخارج، من خلال المواد النظرية والعملية والدراسات والمشاريع البحثية، بهدف إعداد خريجينا لخدمة مجتمعهم وتحسين مستوى مرافق وخدمات الرعاية الصحية.  يحصل الطالب على تعليم أكاديمي بمستوى عالمي يهيء المهندسين في المجال بالأسس الهندسية وفهم جسم الإنسان كنظام هندسي متكامل، والعمل على تطبيق أساليب البحث لتحديد التحديات الهامة التي تؤثر على صحة الإنسان وعلى حلها بكفاءة.

بعض المعلومات عن القسم:

- قسم الهندسة الطبية حاصل على الاعتماد الأكاديمي الأمريكي (ABET).
- يحقق القسم ترتيب متقدم  بين كافة أقسام الهندسة الطبية الحيوية في الجامعات الأردنية وذلك وفقا لتصنيف هيئة اعتماد مؤسسات التعليم العالي وكفائتها.
- حصل القسم على عدد من الجوائز من جمعية الهندسة الطبية التابعة لمنظمة (IEEE) العالمية.
- إستلم الخريجون عدّة جوائز في منافسات و مسابقات مشاريع التخّرج و المنظمة من قبلنقابة المهندسين الاردنيين حيث حصل القسم على عددة جوائز في هذا المجال.
- مشاركة أعضاء هيئة التدريس في المؤتمرات والبرامج الوطنية والمنتديات الثقافية والدورات.
- حصول عدد من أعضاء الهيئة التدريسية على جوائز محلية ودولية.
- نشر مجموعه كبيرة من الابحاث و المقالات في مجلات دولية مرموقة.
- حصل القسم على منح مالية لدعم مجموعة من الابحاث المهمة.
- يحضر القسم لتطوير خطط برنامج البكالوريوس لمواكبة التطورات في المجال لا سيما في مجالات الذكاء الاصطناعي والادارة السريرية والمعلوماتية.
- يحضر القسم لافتتاح برنامج ماجستير في الهندسة الطبية في المستقبل المنظور.